近年来，绍兴鉴湖国家湿地公园常态化开展鸟类调查保护工作。2022年浙江省迁徙水鸟同步调查人员在鉴湖国家湿地公园开展调查时记录到多达100余只鸳鸯，是越城区有记录以来最大规模鸳鸯种群。
2023年湿地公园组织开展了一系列观鸟活动，新发现国家一级重点保护鸟类黄胸鹀，新增千余只金鸻、牛背鹭等候鸟。
今年年初，浙江省迁徙水鸟同步调查时观察到了灰背椋鸟，是绍兴市鸟类新记录，作为罕见鸟种也为它在浙江省内的越冬分布区域提供了新点位。
目前，公园内有鸟类146种，其中有国家一级重点保护鸟类1种，国家二级重点保护鸟类15种。每年10月底至来年4月，是候鸟大群越冬迁飞的时节，也是鉴湖湿地观鸟的最佳季节，能观测到黄胸鹀、鸳鸯、灰背椋鸟等特色鸟类/珍稀濒危鸟类。
为了更加方便公众观鸟，公园内布置了多样的观鸟设施设备，包括观鸟塔、观鸟路线及指示牌、观鸟设备（望远镜、长焦数码相机等），同时新增的观鸟屋、观鸟廊、观鸟平台等设施也正在建设中。